Cukety omyjeme, očistíme, podélně rozpůlíme, lžící vyjmeme zrníčka. Částečně je vydlabeme a uvnitř osolíme a opepříme. Šalotku oloupeme a nadrobno posekáme. Rajčata spaříme vroucí vodou, oloupeme, rzočtvrtíme a zbavíme zrníček. Čtvrtky rajčat pak pokrájíme na kostky. Vařenou šunku pokrájíme na kostičky. Troubu předehřejeme na 180 °C. Šalotku, rajčata a šunku dobře promícháme s čerstvým sýrem. Okořeníme posekanými lístky tymiánu a mletou paprikou, osolíme a opepříme. Půlky cuket naplníme sýrovou nádivkou. Zapékací formu vymažeme, vložíme do ní naplněné půlky cuket a v předehřáté troubě zapékáme 20-25 minut.
Upečené plněné cukety vyjmeme z trouby, upravíme na plochou mísu, případně ozdobíme cuketovými květy a podáváme. Jako příloha se hodí rýže s rajčatovou omáčkou.